Les espècies més destacades són:

Fauna

Amfibis
Banyoles és un paradís per als amfibis. Els estanys i el seu entorn ofereixen a granotes, gripaus, salamandres i tritons un medi propici per a la vida. Se n’hi troben onze espècies, entre les quals la salamandra destaca per la vistositat dels seus colors.

Tortugues d’aigua dolça

Dues espècies de tortugues autòctones, la de rierol i la d’estany, conviuen als estanys, tot i que amb poblacions minses i molt amenaçades per l’expansió de l’agressiva tortuga de Florida.

Flora i vegetació

           Arbres de ribera

Verns, salzes, arbres blancs i freixes envolten els estanys i ofereixen refugi a la seva fauna, especialment a les més de cent espècies d’ocells que s’hi han censat.

Al seu recer i emergint sobre la superfície de l’aigua, el canyís, la balca i els lliris completen un ric mosaic vegetal.