Las zonas húmedas son, junto a los ríos, el hábitat más rico y a la vez amenazado en Catalunya, con una disminución global del 50% de especies en los últimos 20 años. El cambio climático también agrava esta situación. Su restauración es una de las más potentes respuestas y soluciones para revertirlo.

La Fundación ha impulsado muchos proyectos de restauración : el estanque de Ivars , las lagunas de Can Morgat en Banyoles, las salinas de la Tancada y la laguna del Aufacada en el delta del Ebro, etc. Actualmente, centra sus esfuerzos en la restauración del estany de Sils, en convenio con la Fundación Emys, el Ayuntamiento de Sils y la Agencia Catalana del Agua. Y a través del Centro de Resiliencia Climática está participando en el proyecto BIORESILMED (2023-2025) para restaurar la surgencia de los Ullals de Panxa en el delta del Ebro y, a la vez, contribuir a un modelo de economía circular basada en los espacios naturales en el delta.